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单细胞分析常见疑问解答 | 尊龙凯时生物医疗探索

来源:农壮心 日期:2025-03-08

尊龙凯时生物科技在单细胞测序领域展现了革命性的技术,尤其是基于10× Genomics技术的应用,可在单细胞分辨率上获取基因组、转录组和表观组的数据。这项技术的原理可归纳为以下几个关键步骤:

单细胞分析常见疑问解答 | 尊龙凯时生物医疗探索

步骤一:单细胞悬浮液制备

首先,将组织或细胞样本转化为单细胞悬浮液,通常使用机械或酶处理的方法。

步骤二:微滴封装

将单细胞悬浮液与特殊的凝胶珠混合,这些凝胶珠上标记有独特的分子标签(条形码)。利用微流体技术,单个细胞与一个凝胶珠被封装到微滴中,确保每个微滴仅包含一个细胞和一个凝胶珠。

步骤三:mRNA捕获与条形码标记

微滴中的细胞破裂后释放出mRNA。这些mRNA与凝胶珠上的寡核苷酸探针结合,探针带有聚A尾,以便与mRNA的3'端结合,从而实现细胞特异性条形码和独特分子标识符(UMI)的捕获。UMI帮助消除PCR扩增过程中的偏差,确保原始mRNA分子数量的准确估计。

步骤四:逆转录与扩增

捕获的mRNA被逆转录成cDNA,并在微滴中进行PCR扩增,在此过程中,细胞特异性条形码和UMI被保留并扩增至每个cDNA分子中。

步骤五:cDNA文库制备

扩增的cDNA从微滴中收集,建立测序文库,文库中包含带有细胞特异性条形码和UMI的cDNA分子。

步骤六:高通量测序

利用高通量测序平台(如Illumina)对cDNA文库进行测序,测序数据可用于分析基因表达水平、异质性及细胞亚群的鉴定等。

步骤七:数据分析

对测序数据进行处理和分析,确保读取(reads)能正确分配到不同的细胞,并根据UMI计算基因表达量。此外,这些数据还可用于进一步的生物信息学分析,如细胞聚类、差异表达基因的发现和细胞间相互作用的研究。

单细胞测序及转录组测序的可重复性与指导意义

单细胞测序与转录组测序在生物学研究中的价值不可低估。它们为我们提供了细胞和组织的深刻洞察。然而,在评估这些技术的可重复性和指导意义时,需要关注几个关键方面:

可重复性

确保实验结果的可重复性需要成熟的技术和严格的实验流程。从实验设计、样品制备到数据处理的每个环节都可能影响实验结果。研究者需关注实验过程,并实施严格的质量控制。

生物学背景

为了最大化单细胞测序与转录组测序的指导价值,研究者必须深入了解所研究的生物系统和背景。这些技术所提供的信息与基因表达和调控密切相关,因此相关领域的知识至关重要。

数据解析与解释

数据分析和解释是关键的步骤,选择正确的分析方式及结果解读对实验指导意义至关重要。为了保证数据分析的可靠性,研究者需要利用经过验证的分析工具和作业流程。

整合其他数据类型

单细胞和转录组测序提供基因表达的信息,但往往需要与其他数据类型(如基因组、表观组和蛋白质组数据)结合,才能全面理解生物过程。整合多种数据,研究者能够更深入地理解基因调控和功能,提升研究的指导意义。

单细胞质谱流式技术分析的测量原理

尊龙凯时生物科技还在单细胞质谱流式技术(CyTOF)分析中发挥重要作用。该技术结合了流式细胞仪和质谱,主要用于分析细胞表面和内部的分子。流式细胞仪通过激光或其他光源检测单个细胞,实现细胞体积和尺寸的测量,主要基于以下原理:

前向散射(FSC)

FSC与细胞大小有关。当激光照射细胞时,细胞会将一部分激光向前散射。较大的细胞会散射更多光,因此FSC常用来估算细胞的大小。

侧向散射(SSC)

SSC则与细胞的复杂性或颗粒度相关。激光照射细胞后,内部颗粒会将光向侧面散射,SSC可用来估计细胞的颗粒度和内部结构的复杂性。

染料测量

某些流式细胞术还利用染料测量细胞体积。这些染料能选择性结合细胞质,结合量与细胞体积成正比。通过测量荧光强度,研究者能估算细胞体积。

尊龙凯时致力于提供高质量的生物质谱分析服务,帮助客户在生物制药和医疗器械领域实现精准的质量控制检测及项目验证。通过严格遵循国际标准,并注重数据的可靠性与实时性,我们将继续为广大客户提供增值服务。

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